Wojny klonów rozprzestrzeniły się na całą galaktykę. Bohaterscy rycerze Jedi walczą by utrzymać porządek i przywrócić pokój galaktyce. Coraz więcej systemów pada ofiarą ciemnej strony Mocy ponieważ Republika Galaktyczna ugina się pod władzą Separatystów i ich nowej ogromnej armii droidów. Anakin Skywalker i jego uczeń Padawan Ahsoka Tano znajdują się na misji z daleko idącymi konsekwencjami. Pierwsze to spotkanie twarzą w twarz z lordem kryminalistów Jabbą the Hutt. Jednak Hrabia Dooku i jego
groźni agenci, wliczając w to nikczemną Asajj Ventress upewniają się, ze Anakin i Ashoka zawodzą przy w ich poszukiwaniu. Przez ten czas, na liniach frontu Wojen Klonów, Obi-Wan Kenobi i Mistrz Yoda prowadzą masywną armię klonów by stawić opór siłom zbrojnym ciemnej strony.